Da Giglio Porto partono specifiche escursioni per la vicina Isola di Giannutri e per l’Isola di Pianosa. Sempre da qui partono varie imbarcazioni di media grandezza che conducono i turisti per un giro dell’isola con soste per il bagno nei punti più belli, lo stesso servizio viene anche garantito sia al porto che nelle principali spiagge dai barcaioli che con barche e gommoni più piccoli partono alla scoperta del Giglio dal mare.